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注册小规模公司时，有一些费用是可以抵扣个税的。主要包括以下几个方面。
1、增值税，小规模纳税人可以享受增值税的优惠政策，如月销售额不超过一定数额的免征增值税，这些减免的增值税可以作为所得税的抵减项，从而减轻公司的税务负担。
2、员工工资，为员工支付工资时，工资支出可以在企业所得税前扣除，这意味着工资支出可以减轻企业的税务负担，为员工购买社保的支出也可以作为公司费用进行抵扣。
3、运营成本，如办公场所租金等运营成本也可以作为公司费用进行抵扣，这些费用有助于降低公司的税务负担。
4、合法凭证的票据支出，公司如果有合法凭证的票据支出，如购买办公用品、原材料等，也可以作为费用进行抵扣，但需要注意，这些票据必须是正规的、合法的，否则无法享受抵扣的待遇。
注册小规模公司时，可以抵扣个税的费用包括增值税、员工工资、运营成本和合法凭证的票据支出等，但需要注意，具体的税务政策可能会因地区和行业而有所不同，建议公司在实际操作中咨询当地税务部门或专业会计师的意见。